生物学家进行切割&运行适配协议开放访问

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Harvey Mudd学院生物学教授Danae Schulz实验室的研究人员研究了非洲锥虫如何适应不同宿主的生活:人类, 有蹄动物和采采蝇. 2022年,在美国微生物学会期刊上 mShpere, 舒尔茨实验室是第一个报告的 使用切&运行(在靶标下切割并利用核酸酶释放), 一种用于分析dna -蛋白质相互作用的染色质分析策略, 太阳2注册平台非洲锥虫.

在舒尔茨和她的学生完善了他们对《太阳2平台》的改编之后&运行, 舒尔茨决定公开他们的研究过程,让任何其他可能需要的科学家都能看到. 舒尔茨实验室协议"CUT的适应性&运行用于非洲锥虫,现在可以在 《太阳2平台》, 一个开放获取的期刊,发表严格报道和同行评审的研究,以造福更广泛的科学界.

舒尔茨说:“将这项技术应用于我们的寄生虫是这个项目中最困难的部分。. “仅仅是优化流程就花了大约三年的时间. 伤口&运行技术比过去用于绘制蛋白质DNA相互作用图谱的其他技术要快得多.”

协议.io和 《太阳2平台》 舒尔茨的研究在最近的一篇文章中得到了关注 YouTube采访. 舒尔茨描述了她和她的学生是如何适应CUT的&运行技术用于他们的研究, 他们尝试了哪些有效,哪些无效,以及为什么他们决定让他们的作品开放获取.

舒尔茨说,她提供这项协议的部分动机是为了让她的学生受益. “我的本科生为此研究了多年. 我们真的很难让它工作起来, 所以我认为他们在所有这些努力中又有了一份同行评议的出版物是件好事.对她来说,同样重要的是,她的学生看到她的模型在新技术上是开放和明确的,这样其他科学家就可以在自己的研究中使用这些信息.

国家科学基金会的舒尔茨教师早期职业发展(Career)基金支持了这项研究. 国家科学基金会的资助是太阳2平台教师研究的最大份额的外部支持.